وفي 23 مايو 2006 وقعت البلدان بروتوكولاً إضافياً لاتفاقية التبادل الحر بينهما بهدف الإسراع بعملية التحرير
الجمركي بين البلدين.. علاوة على
اتفاقية "إعلان أغادير" التي تربط المغرب بمجموعة من الدول العربية من بينها مصر، والتي دخلت حيز التنفيذ منذ يوليو 2007.
وقد تطور حجم
الصادرات بين البلدين خلال السنوات الأخيرة تطورًا إيجابيًا، حيث وصل حجم التبادل التجاري بينهما إلى نحو 389 مليون دولار في عام 2008، حيث تبلغ
الصادرات المصرية إلى المغرب نحو 347 مليون دولار فيما بلغ حجم
الواردات المصرية من المغرب نحو 41.5 مليون دولار.